Russian Journal of AllergyRussian Journal of AllergyРоссийский Аллергологический Журнал1810-88302686-682XPublishing House ABV Press79810.36691/RJA798ArticlesСтатьиUSE OF MOLECULAR GENETIC METHODS IN THE STUDY OF HEREDITARY PREDISPOSITION TO ATOPIC DISEASES INCHILDRENИСПОЛЬЗОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ МЕТОДОВ В ИССЛЕДОВАНИИ НАСЛЕДСТВЕННЫХ ОСНОВ ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТИК АТОПИЧЕСКИМ БОЛЕЗНЯМ У ДЕТЕЙTyumentsevaE SТюменцеваЕ С

Учреждение Российской академии медицинских наук Научный центр здоровья детей РАМН

e_s_t@mail.ruPetrovaN VПетроваН В

Учреждение Российской академии медицинских наук Медико-генетический научный центрРАМН

BalabolkinI IБалаболкинИ И

Учреждение Российской академии медицинских наук Научный центр здоровья детей РАМН

PinelisV GПинелисВ Г

Учреждение Российской академии медицинских наук Научный центр здоровья детей РАМН

TumentsevaE S

Children Health Research Centre

PetrovaN V

Research Centre for Medical Genetics, Russian Academy of Medical Sciences

BalabolkinI I

Children Health Research Centre

PinelisV G

Children Health Research Centre

Учреждение Российской академии медицинских наук Научный центр здоровья детей РАМНУчреждение Российской академии медицинских наук Медико-генетический научный центрРАМНChildren Health Research CentreResearch Centre for Medical Genetics, Russian Academy of Medical Sciences1506201183NO3 (2011)№3 (2011)485510032020Copyright ©; 2011, Pharmarus Print MediaCopyright ©; 2011, Фармарус Принт Медиа2011Pharmarus Print MediaФармарус Принт Медиаhttps://rusalljournal.ru/raj/article/view/798

Background. Study of the аssociations of susceptibility genes to the development of atopic diseases in children. Materials and methods. All 325 examined children reside on the territory of the European part of Russia who by according to surveys, Russian by nationality. Analysis of polymorphism in genes of receptors ADRB2, GRL, ALOX5, genes of biotransformation - CYP1A1, CYP2C9, CYP2C19, GSTT1, GSTM1, NAT2 as well as the variants of the genes MTHFR and TNFA was performed in patients suffering from atopic disease and in healthy individuals. Using Multifactor Dimentionality Reduction method (MDR) it was defined the most significant model of genegene interaction for the development of atopic disease Results. Association of the development of atopic diseases with polymorphic variants of the genes: ALOX5 (VNTR) GRL (1220A > G) TNFA (-308G > A) CYP1A1 (6235T > C) and GSTM1 was identified in surveyed children. The highrisk alleles and genotypes of developing atopic diseases in pediatric patients were determined. Using Multifactor Dimentionality Reduction method (MDR) it was defined the most significant model of gene-gene interaction for the development of atopic disease, including ADRB2 (79 C >G), (46A > G), CYP2C19 (G681A) was defined. Conclusion. There were identified polymorphic variants of genes and important gene-gene interactions associated with development of atopic diseases in children.

Цель. Исследование ассоциаций генов предрасположенности к развитию атопических болезней у детей. Материалы и методы. Все 325 обследованных детей проживают на территории Европейской части РФ: по данным опросов, русские по национальности. Проведен анализ полиморфизма генов рецепторов ADRB2, GRL, ALOX5, генов системы биотрансформации - CYP1A1, CYP2C9, CYP2C19, GSTT1, GSTM1, NAT2, а также вариантов генов MTHFR и TNFA у пациентов, страдающих атопическими болезнями, и здоровых индивидов. Результаты. Выявлена ассоциация полиморфных вариантов генов ALOX5 (VNTR), GRL (1220A>G), TNFA (-308G>A), CYP1A1 (6235T>C) и GSTM1 с развитием атопических болезней у детей. Определены аллели и генотипы повышенного риска развития атопических заболеваний у пациентов детского возраста. С помощью метода MDR (Multifactor Dimentionality Reduction) определена наиболее значимая для развития атопических заболеваний модель взаимодействия генов. Заключение. Определены полиморфные варианты генов и значимые межгенные взаимодействия, ассоциированные с развитием атопических болезней у детей.

GRLALOX5genes of xenobiotic biotransformation systemgenes of receptors ADRB2GRLALOX5gene-gene interactionsatopic diseases in childrenгены системы биотрансформации ксенобиотиковгены рецепторов ADRB2межгенные взаимодействияатопические болезни у детейRisch N.J. Searching genetic determinants in the new millennium. Nature. 2000, v. 405, p. 847-856.Hirschhorn J.N., Lohmueller K., Byrne E., Hirschhorn К. A comprehensive review of genetic association studies. Genet. Med. 2002, v. 4, No. 2, p. 45-61.Lohmueller K.E., Pearce C.L., Pike M. et al. Meta-analysis of genetic association studies supports a contribution of common variants to susceptibility to common disease. Nature Genet. 2003, v. 33, p. 177-182.Баранов В.С., Баранова Е.С., Иващенко Т.Э., Асеев М.В. Геном человека и гены «предрасположенности»: введение в предиктивную медицину. СПб., «Интермедика». 2000, 263 с.Полоников А.В. Полиморфизм генов ферментов биотрансформации ксенобиотиков и их комплексное влияние на предрасположенность к мультифакториальным заболеваниям. Автореферат диссертации д-ра мед. наук. М., 2006, 48 с.Cooper R.S. Gene-environment interactions and the etiology of common complex disease. Ann. Intern. Med. 2003, v. 139. p. 437-440.Глотов А.С., Наседкина Т.В., Иващенко Т.Э. и cоавт. Создание биочипа для анализа полиморфизма в генах системы биотрансформации. Мол. биол. 2005, т. 39, № 3, с. 403-412.Баранов В.С. Генетический паспорт - основа индивидуальной и предиктивной медицины. СПб., «Издательство Н-Л». 2009, 528 с.Богорад А.Е.. Фармакогенетика бронхиальной астмы. Рос. Аллергол. жур. 2005, № 4, с. 9-16.Брянцева О.Н., Тихомиров Е.Е., журкова Н.В. и соавт. Полиморфизм гена β2-адренергического рецептора и эффективность бронхолитической терапии у детей с бронхиальной астмой. Педиатрическая фармакология. 2007, № 3, с. 35-39.Anderson W., Kalberg С., Edwards L. et al. Effects of polymorphisms in the promoter region of 5-lipoxygenase and LTC4 synthase on the clinical response to zafirlukast and fluticasone. Eur. Resp. J. 2000, v. 16 (Suppl B), р. 183S.Mathew C.C. The isolation of high molecular weight eucariotic DNA. Methods in Molecular biology. Ed. Walker J.M. N.Y.: Human press. 1984, v. 2, p. 31-34.Gra O., Mityaeva O., Berdichevets I. et al. Microarray-Based Detection of CYP1A1, CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6, GSTT1, GSTM1, MTHFR, MTRR, NQO1, NAT2, HLA-DQA1, and AB0 Allele Frequencies in Native Russians. Gen.Test. Mol. Biom. 2010, v. 14, No. 3, p. 329-342.Herb F., Thye T., Niemann S. et al. ALOX5 variants associated with susceptibility to human pulmonary tuberculosis. Hum. Mol. Genet. 2008, v. 17, No. 7, p. 1052-1060.Федорова Ю.Ю., Карунас А.С., Нургалиева А.Х. и cоавт. Роль полиморфных вариантов генов системы биотрансформации в развитии аллергических заболеваний у татар. Мед. ген. 2010, № 6, с. 28-35.Брагина Е.Ю., Фрейдин М.Б., Рудко А.А. и соавт. Полиморфизм генов CYP2E1, CYP2C19, GSTT1, GSTM1, GSTP1 в развитие атопической бронхиальной астмы и туберкулеза. Гены народонаселения и патология: сборник научных трудов. Вып. 8. Томск, 2007, с. 55-57.Макарова О.Г., Сафронова В.А., Вавилин и соавт. Показатели атопии у детей с бронхиальной астмой возрастают с накоплением нуль-аллелей глутатион-S-трансферазы М1. Бюл. эксп. биол. 2004, т. 138, с. 520-522.Brasch-Andersen Ch., Christiansen L., Tan Q. et al. Possible gene dosage of glutathione-S-transferases on atopic asthma. Using real-time PCR for quantification of GSTM1 and GSTT1 gene copy numbers. Hum. Mutat. 2004, v. 24, No. 3, p. 208-214.Lam S., Chan H., Le Riche J.С. et al. Release of leukotrienes in patients with bronchial asthma. J. Allergy Clin. Immunol. 1988, v. 81, p. 711-717.Anderson W., Kalberg С., Edwards L. et al. Effects of polymorphisms in the promoter region of 5-lipoxygenase and LTC4 synthase on the clinical response to zafirlukast and fluticasone. Eur. Resp. J. 2000, v. 16 (Suppl B), p. 183S.Останкова Ю.В., Иващенко Т.Э., Келембет Н.А. и cоавт. Ассоциация полиморфизма промоторной части гена TNFα с развитием атопической бронхиальной астмы. Экологичекая генетика. 2005, т. 3, с. 3-11.Shin Y.D., Park B.L., Kim L.H. et al. Association of tumor necrosis factor polymorphisms with asthma and serum total IgE. Hum. Mol. Genet. 2004, v. 13, No. 4, p. 397-403.Hahn L.W., Ritchie M.D., Moore J.H. Multifactor dimentionality reduction software for gene-gene and gene-environment interactions. Bioinformatics. 2003, v. 19, No. 3, p. 376-382.Ritchie M.D., Hahn L.W. Roodi N. et al. Multifactor-dimentionality reduction reveals high-order interactions among estrogen-metabolism genes in sporadic breast cancer. A. J. Hum. Genet. 2001, v. 69, p. 138-147.